肠道功能障碍会导致便秘和不自觉的肠道运动，影响大约60%的ms患者解决这个问题需要患者和临床医生的系统坚持。重要的是要记住肠功能障碍，就像其他疾病一样女士的症状，可以随着时间的推移而改变，当保守治疗不成功时，推荐给胃肠病学家是适当的。
便秘可根据下列建议予以减少:
回顾你的药物。几种类型的药物可以沉淀或加剧便秘，回顾药物应该是评价便秘的第一步。导致便秘的常见药物包括抗高血压药、抗胆碱药、镇痛药/麻醉剂、镇静剂/镇定剂、三环抗抑郁药、一些抗生素、抗酸剂、利尿剂和铁补充剂。
管理膀胱的问题首先，喝大量的液体。如果大小便功能障碍同时存在，膀胱问题应该首先解决。一旦泌尿系统症状不再是一个主要的问题，患者应增加液体摄入量，以防止脱水（干涸）大便这就很难沿着胃肠（GI）道和疏散移动。一般推荐的液体摄入量是每天2升。
多吃富含纤维的食物，大块食品和浓缩糖制品。除了液体，西梅汁和/或干果也有帮助。充足的膳食纤维是必不可少的;如果不能实现高纤维饮食，可以大量补充，如Metamucil, FiberCon, Perdiem，或Citrucel。经常喝一两杯透明液体(如水，苹果汁，汤汁，茶)以获得充分的益处。液体糖浓缩液(如山梨醇、乳果糖和糖蜜)是另一种选择，它能将水吸入肠道，从而软化粪便。副作用很少，这些药物是有用的长期管理。
行为改变。一旦你有了一个适合你生活方式的计划，坚持下去。定期锻炼。安排一个有规律的时间，利用胃绞痛反射，在饭后20-30分钟，特别是在早餐后。
药物治疗。口服药物(如Colace, Surfak, Peri-colace, Phillips ' s Milk of Magnesia)和膳食补充剂(如镁)有助于缓解粪便通过胃肠道的通道。栓剂可以帮助润滑粪便(甘油栓)或化学刺激直肠排便(bisacodyl栓)。重要的是，病人或护理人员将栓剂插入直肠壁而不是粪便中。灌肠剂(如迷你灌肠剂)含有大便软化泻药。少量或自来水灌肠剂应保留以供偶尔使用。
不自觉的肠或大便失禁可能是由于一些病理情况：括约肌功能障碍，便秘与直肠过载和溢出，和/或降低直肠感觉。由于大便失禁常常与便秘有关，许多干预措施是相似的。不过，也有当报告大便失禁首先考虑的几个因素。
饮食刺激物(如咖啡因和酒精)应被视为促成因素并予以消除。减少痉挛的药物可能需要调整。当肠道过度活跃是失禁的根本原因时，抗胆碱能药物是有用的。但由于这些药物也会影响膀胱功能，因此需要谨慎的起始和滴定，并应监测空后残余尿量，以避免沉淀尿潴留。排便受阻可导致大小便失禁。当腹泻导致大便失禁，腹泻的原因需要确定和解决。
欲知更多有关肠功能障碍的资料，请参阅膀胱直肠” MS焦点专刊刊登在多发性硬化症国际联合会（2014年7月）。